Se ocupa de la Catalogación, Inventario y Registro de la Colección Estable del Museo, compuesta en la actualidad de 37.404 piezas, consignadas sobre libros de registro y fichas de papel.
En la actualidad este Servicio está desarrollando, a iniciativa de la Subdirección General de Museos, el Proyecto Domus, consistente en la creación de una base de datos común de los fondos museográficos y documentales de los museos de titularidad estatal, dependientes de la Dirección General de Bellas Artes y Bienes Culturales. Dicha base de datos contendrá además los fondos bibliográficos, documentación administrativa, imágenes digitalizadas de cada una de las piezas, e información referente a movimientos y conservación de los fondos museográficos. En un futuro próximo los datos consignados serán accesibles para cualquier investigador, institución o usuario que solicite la información.